Научно-методический семинар "Суперкомпьютерное многомасштабное моделирование конденсированного состояния и живых систем"
Во вторник, 20 февраля, Международная лаборатория суперкомпьютерного атомистического моделирования и многомасштабного анализа приглашает вас принять участие в ежемесячном научно-методическом семинаре "Суперкомпьютерное многомасштабное моделирование конденсированного состояния и живых систем"
С докладом на тему "Дизайнерский блокатор калиевого канала: повышение селективности методом белковой топографии" выступит старший научный сотрудник лаборатории Чугунов А.О.
Аннотация доклада:
Одним из свежих трендов в структурной биохимии является компьютерный дизайн новых функций в белковых молекулах. В пример можно привести пептид Tk-hefu, полученный в Институте биоорганической химии путем мутагенетической «пересадки» функционально важных остатков из токсина яда скорпиона в защитный пептид растений. В результате Tk-hefu приобрел новый тип активности — блокирование потенциал-чувствительных калиевых каналов (Kv), что было не свойственно исходному пептиду, но являлось природной функцией токсина из яда скорпиона[1].
Методом молекулярного моделирования мы установили возможную структуру комплекса этого блокатора со своей мишенью — каналом Kv1.3. Применение разработанной нами методики «белковой топографии» [2] позволило проанализировать характеристики этого комплекса и предложить аминокислотную замену, которая должна увеличить сродство к Kv1.3. «Дизайнерский» пептид Tk-hefu-2 был синтезирован, и его активность по отношению к Kv1.3 возросла в 20 раз. Молекулы, подобные Tk-hefu, являются точными инструментами нейробиологических исследований, а также прототипами лекарств, эффективных при каналопатиях.
1. Berkut, A. A., Usmanova, D. R., Peigneur, S., Oparin, P. B., Mineev, K. S., Odintsova, T. I., ... & Vassilevski, A. A. (2014). Structural similarity between defense peptide from wheat and scorpion neurotoxin permits rational functional design. J. Biol. Chem. 289, 14331-14340.
2. Koromyslova, A. D., Chugunov, A. O., & Efremov, R. G. (2014). Deciphering fine molecular details of proteins’ structure and function with a Protein Surface Topography (PST) method. J. Chem. Inf. Model. 54, 1189-1199.
Дата и время: 20.02.2018, 12:00 - 15:00
Адрес: Москва, ул.Таллинская, 34, ауд. 311