Гросси Хоас Сантьяго рассказывает о работе на позиции постдока
Научный сотрудник Гросси Хоас Сантьяго делится своими мыслями с другими коллегами об опыте работы:
Open-source GPU-технологии для суперкомпьютеров: ученые разобрались в плюсах и минусах
Исследователи Международной лаборатории суперкомпьютерного атомистического моделирования и многомасштабного анализа НИУ ВШЭ, ОИВТ РАН и МФТИ сравнили работу популярных программ молекулярного моделирования на GPU-ускорителях AMD и Nvidia. В опубликованной работе в журнале International Journal of High Performance Computing Applications ученые впервые перенесли LAMMPS на новую open-source GPU-технологию AMD HIP.
Высокая оценка работы сотрудников Международной лаборатории суперкомпьютерного атомистического моделирования и многомасштабного анализа на PPAM-2019
Работа сотрудников Международной лаборатории суперкомпьютерного атомистического моделирования и многомасштабного анализа НИУ ВШЭ, выполненная под руководством профессора Владимир Стегайлова с участием выпускника 2019 года бакалавриата МИЭМ Евгения Кузнецова, аспиранта 1-го года НИУ ВШЭ Всеволода Никольского, магистранта МФТИ Михаила Логунова и младшего научного сотрудника лаборатории Николая Кондратюка, была признана лучшей работой из основной программы 13-й Международной конференции по параллельным вычислениям и прикладной математике (PPAM-2019, http://ppam.pl), проходившей в г. Белосток (Польша) с 8 по 11 сентября 2019.
Вторая школа-семинар "Суперкомпьютеры в научных исследованиях: горизонты многомасштабного моделирования и эффективного суперкомпьютерного ко-дизайна"
В рамках продвижения современных суперкомпьютерных технологий для нужд научных исследований лаборатория САММА организовала вторую школу-семинар "Суперкомпьютеры в научных исследованиях: горизонты многомасштабного моделирования и эффективного суперкомпьютерного ко-дизайна". Данное мероприятие объединяет вместе разработчиков передовых суперкомпьютерных технологий и учёных, использующих высокопроизводительные вычисления в своих исследованиях. Первый день был посвящён анализу новых технических решений для высокопроизводительных вычислений, а второй - приложениям суперкомпьютерного моделирования, применению метода молекулярной динамики к реальным задачам материаловедения и молекулярной биологии.
Четвёртый семинар «Суперкомпьютерное и многомасштабное моделирование конденсированного состояния и живых систем»
На семинаре 15 мая 2018 года к.ф.-м.н. Полянский А.А. из ИБХ РАН прочитал лекцию на тему "Молекулярный механизм активации рецептора фактора роста тромбоцитов, опосредованный его трансмембранным доменом". В докладе представлены результаты комплексного исследования с использованием современных методов компьютерного молекулярного моделирования и биохимических экспериментов. Результатом стала модель активации этого рецептора, описание принципа работы онкогенной мутации и предложенная компенсирующая мутация в трансмембранном домене.
Третий семинар «Суперкомпьютерное и многомасштабное моделирование конденсированного состояния и живых систем»
В апреле состоялся третий научно-практический семинар, организованный Международной лабораторией САММА. На данном семинаре профессор Калиничев А.Г. продолжил рассказ о результатах участия в международном семинаре "ShaleXenvironmenT Qatar Dissemination event" по проблемам добычи сланцевых ископаемых и применении методов молекулярной динамики в этой области.
Второй ежемесячный семинар «Суперкомпьютерное и многомасштабное моделирование конденсированного состояния и живых систем»
На втором научно-практическом семинаре обсуждались итоги участия сотрудников Лаборатории в двух международных конференциях. Зам. зав. лабораторией Стегайлов В.В. и в.н.с. Тимофеев А.В. поделились новостями с международного суперкомпьютерного съезда "Supercomputing frontiers Europe 2018", прошедшего в Варшаве, а профессор Калиничев А.Г. рассказал о поднятой на международном семинаре "ShaleXenvironmenT Qatar Dissemination event" проблеме добычи сланцевых ископаемых и применении методов молекулярной динамики в этой области.
Первый ежемесячный семинар «Суперкомпьютерное и многомасштабное моделирование конденсированного состояния и живых систем»
На первом научно-методическом семинаре Лаборатории САММА старший научный сотрудник Чугунов А.О. выступил с докладом «Дизайнерский» блокатор калиевого канала: повышение селективности методом белковой топографии». Были представлены последние результаты в области компьютерного моделирования взаимодействия искусственного пептида Tk-hefu с его мишенью - калиевым каналом Kv1.3.